Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BckdkO55028 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BckdkO55028 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms