Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms