Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SlkO54988 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SlkO54988 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SlkO54988 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SlkO54988 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms