Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csnk2a2O54833 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms