Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek2O35942 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nek2O35942 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nek2O35942 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms