Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccl25O35903 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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