Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lhx8O35652 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lhx8O35652 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lhx8O35652 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Lhx8O35652 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx8O35652 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms