Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc1a6O35544 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms