Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk4O35493 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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