Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc27a2O35488 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms