Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sema6aO35464 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sema6aO35464 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms