Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TnxbO35452 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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