Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms