Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf5O35326 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf5O35326 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms