Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmiO35309 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmiO35309 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NmiO35309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NmiO35309 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NmiO35309 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NmiO35309 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms