Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn9O35239 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms