Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CenpaO35216 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CenpaO35216 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms