Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn4O35054 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn4O35054 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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