Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha8O09127 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms