Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EllO08856 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EllO08856 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EllO08856 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EllO08856 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EllO08856 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EllO08856 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms