Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms