Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms