Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Barx2O08686 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Barx2O08686 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms