Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3239L7N2D9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms