Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20939L7N243 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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