Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm4312K9J7E2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms