Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm2056J3QQ02 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms