Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5849J3QPE5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5849J3QPE5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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