Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm933J3QPC1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm933J3QPC1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms