Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm20918J3QN17 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm20918J3QN17 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm20918J3QN17 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Gm20918J3QN17 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20918J3QN17 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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