Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfp616J3QN14 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfp616J3QN14 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms