Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700014D04RikJ3QMS2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms