Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lipo1J3QME6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lipo1J3QME6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms