Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm3727J3QM54 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm3727J3QM54 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3727J3QM54 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm3727J3QM54 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3727J3QM54 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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