Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm6594J3QM43 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6594J3QM43 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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