Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm20828J3KMI7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20828J3KMI7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20828J3KMI7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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