Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spdye4cI6XKQ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms