Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms