Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfip1G5E8V9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms