Protein–RNA interactions for Protein: G5E8K1

2610028H24Rik, RIKEN cDNA 2610028H24, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610028H24RikG5E8K1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2610028H24RikG5E8K1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2610028H24RikG5E8K1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms