Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r58G3X9U3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms