Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SprtnG3X912 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SprtnG3X912 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms