Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms