Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34aG3UW52 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34aG3UW52 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms