Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Farp1F8VPU2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Farp1F8VPU2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms