Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm8005F6YKY3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm8005F6YKY3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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