Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhox13F6YCR7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox13F6YCR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms