Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8444F6XS56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8444F6XS56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms