Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm10378F6XQQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm10378F6XQQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm10378F6XQQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Gm10378F6XQQ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm10378F6XQQ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm10378F6XQQ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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