Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17093F6XGJ4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17093F6XGJ4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms